Как можно зарегистрировать алгоритм работы программы?

Регистрация программ ЭВМ и баз данных производится Российским агентством по патентам и товарным знакам (РОСПАТЕНТ РФ) и дает преимущества в ситуациях, когда авторство или права обладания ставятся под сомнение или оспариваются в суде.

Подробнее о процедуре регистрации Вы можете прочитать в разделе Регистрация программ ЭВМ